注意，呕吐和腹泻并不总是仅仅提示消化道疾病，系统性疾病同样有可能。因此，完整的病史调查可以将消化道症状定义为急性、慢性、间断性、复发性和或渐进性。整个兽医团队的首要任务是将轻微的自限性胃肠道疾病和严重的胃肠道疾病区分开来。如果症状严重，那么该病例需要更全面的诊断方案和住院方案进行积极的治疗。导致进行呕吐和腹泻的病因很多，且可能是多因素导致的。原发性消化道疾病需要和代谢性或系统性疾病区分开来。
初始评价
首先需要评估临床病史，包括：基本情况、疫苗情况、旅行史、环境因素、异物/中毒可能性体重变化、现病史、既往病史、用药情况、饮食情况饮食有无改变、食欲及饮欲
客户需要描述出呕吐或腹泻的频率、量和特征，兽医可以使用粪便评分图示来帮助主人量化这些标准。主人所描述的“呕吐”，需要兽医将其与反流、咳嗽、干呕或作呕相鉴别！
体格检查
完整的提供检查非常重要、精神沉郁、发热或低体温通常提示病情严重。提供口腔或咽部粘膜的检查和皮肤弹性测试可以评估脱水、黄疸或发白。腹部触诊可能发现腹痛、腹胀、腹水或肠壁增厚、器官增大或肿物。直肠检查可以检查是否存在肿物、狭窄、血液、异物或肛门腺疾病，并采集新鲜的粪便样本。
诊断方案
急性呕吐或腹泻的诊断，至少应包括影像学、粪便检查、血常规和总蛋白。快速的电解质检查也很有意义，如果可以检查血糖、尿素氮则更好。粪便检查不仅应检查寄生虫，还需要包括颜色、成型度、异物、粘液和是否有血液。其他应该有的检查还包括：血清生化、尿检、胰腺功能湿抹片/盐水抹片：检查原虫或其他寄生虫粪便染色细胞学/干抹片：检查血细胞、真菌或肿瘤细胞、细菌、酵母菌离心漂浮法：检查寄生虫卵或卵囊粪便培养：通常无意义，除非是检查猫的胎儿三毛滴虫酶联免疫吸附试验（ELISA）：检查细小病毒、贾第虫或隐孢子虫病的抗原PCR消化道组合：检查多种抗原
影像学
应尽可能全面，平片、腹部超声或造影检查有必要时都应该进行。右侧位和腹背位X线片是必须的，如怀疑梗阻或肿物，应该加拍一张左侧位。技术好的超声师可以检查胃、小肠、结肠以及相关器官（胰腺、肝脏、肾脏、肾上腺）。钡餐造影可以口服也可以直肠给药，用于不同的目的。内窥镜、CT、MRI或其他影像学方法也可以考虑，但通常需要麻醉，且通常用于更严重或慢性的病例。
治疗
针对潜在病因进行治疗。系统性治疗通常为输液疗法、营养支持。如果存在或怀疑脱水，应给与平衡晶体液。除了急性呕吐病例，以往的禁食禁水休息胃肠道的理念早就过时了。使用高消化、低残留、高能量的兽医处方食品有助于消化道疾病的回复。怀疑或确诊急性胰腺炎的犬应该限制脂肪摄入。很多药物可以用于呕吐和腹泻的治疗。马罗皮坦用于控制犬猫呕吐通常有效，而抑制胃酸药通常不具有止吐效果，且通常只有怀疑胃溃疡才用。通常，在急性病例中不要使用习惯性使用抗生素，除非慢性有细菌性病原或存在败血症风险。某些研究指出益生菌有助于急性腹泻的康复。
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